Single Nucleotide Polymorfisme gen BMP4 pada kambing berdasarkan data GenBank

Abstract

Gen  BMP4 merupakan golongan growth factor-β (TGFβ) superfamily menunjukkan efek terhadap ovulasi dan litter size pada kambing. Tujuan penelitian ini untuk identifikasi single nucleotide polymorfisme (SNP) gen BMP4 pada kambing berdasarkan data GenBank. Delapan sekuen DNA gen BMP4 kambing digunakan dalam penelitian ini. Data sekuen DNA disejajarkan menggunakan BioEdit untuk mengetahui lokasi SNP dan perubahan asam amino. Lima SNP yang ditemukan pada ekson. Empat SNP (g.143C/A, g.785G/A, g.964C/G dan g.976C/G) bersifat non-synonymous mutation dan SNP g.393G/A bersifat synonymous mutation. Hasil penelitian ini dapat digunakan sebagai informasi dasar untuk melakukan studi asosiasi SNP gen BMP4 dengan sifat reproduksi kambing pada penelitian selanjutnya.